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Wenn ich Daten direkt im Cyberduck bearbeite, und dann aus versehen Cyberduck schließe, dann ist meine ganze Arbeit verloren.

Ich würde davon ausgehen, dass Cyberduck sich nicht schließen lässt, solange er im "Live Bearbeitungsmodus" ist.
Also in etwa so, dass er beim aufrufen des fremden Programms (z.B. Word) sich die Prozess ID holt, und sich solange nicht schließen lässt, wie alle von ihm gestarteten Unterprozesse (Erkennung über die Prozess ID) geschlossen sind.

Ich denke Somit würde man sichergehen, dass die Daten auf jeden Fall wieder auf den Server übertragen werden.

When I edit data directly in Cyberduck, and then close accidentally Cyberduck, then all my work is lost.

I would assume that Cyberduck can not close as long as he is in the "Live edit mode". So something like that when he call the external program (eg Word), the process ID outdated, and as long as does not close, as all launched by him sub-processes (detection via the process ID) are closed.

Thus I think you would make sure that the data is transmitted definitely go back to the server.